良乡校区管理处设4个职能部门，分别为：综合室、后勤保障室、安全保卫室和校地合作室，全面负责校区协调、保障、安全、服务等工作。

（1）综合室：主要负责校内单位的协调联络工作及行政事务处理。

（2）后勤保障室：主要负责校区日常运行和后勤保障工作。

（3）安全保卫室：主要负责校区安全保卫工作。

（4）校地合作室：主要负责统筹协调良乡校区有关工作，代表学校与地方政府和驻区单位沟通联络。